Извиняюсь за такой вопрос, но все таки что значит "закомментировать"? Вот пример:

Так же следует закомментировать в этом файле строки PHP код:

$reputationhighgif = 'highneg';

PHP код:

$reputationhighgif = 'highpos';

PHP код:
if ($reputation_value > 500)
{ // bright green bars take 200 pts not the normal 100
$reputation_value = ($reputation_value - ($reputation_value - 500)) + (($reputation_value - 500) / 2);
}

$reputationbars = intval($reputation_value / 100); // award 1 reputation bar for every 100 points
if ($reputationbars > 10)
{
$reputationbars = 10;
}

Сделай так

/*
$reputationhighgif = 'highneg';

PHP код:
$reputationhighgif = 'highpos';

PHP код:
if ($reputation_value > 500)
{ // bright green bars take 200 pts not the normal 100
$reputation_value = ($reputation_value - ($reputation_value - 500)) + (($reputation_value - 500) / 2);
}

$reputationbars = intval($reputation_value / 100); // award 1 reputation bar for every 100 points
if ($reputationbars > 10)
{
$reputationbars = 10;
}
*/

Каментируется либо так
/*
текст
*/
либо в начале каждой строки, которую нужно закоментить, ставится //

либо вместо // можно # как в скриптах юникса раз на то пошло..

п.с. закомментированный код не выполняется, так что в принципе его можно просто удалить.. комментирование просто даёт возможность быстро восстановить если понадобится
2.п.с. жёлтым цветом в примере как раз и выделены комментарии